Бразаускас в 1992 году был избран председателем Сейма Литвы, а в 1994 стал Президентом страны. В 1998 году не баллотировался на второй срок, однако в 2001 году был утвержден премьер-министром, которым являлся до лета 2006 года, уйдяя в отставку в результате правительственного кризиса.

В последние годы был почетным председателем социал-демократической партии Литвы.