Тим Бертон снял ленту в 3D-формате, и исполнители главных ролей Миа Васиковска, Джонни Депп, Алан Рикман, Майкл Шин и Стивен Фрайснова были вынуждены играть не в декорациях, а в окружении зеленых стен.

Ранее британская сеть кинотеатров Odeon планировала бойкотировать показ "Алисы в стране чудес", поскольку компания Disney решила выпустить фильм на DVD уже через 12 недель после его премьеры в кинотеатрах вместо стандартных 17 недель. Прокатчики возмутились, поскольку потеряли бы значительную часть доходов. Руководство Disney объясняло такой шаг объяснялся борьбой с пиратством, хотя фильм и снят в формате 3D.

Однако компромисс все-таки был найден, и период между премьерой и выходом ленты на DVD составит 13 недель.